В состав комиссии, которую возглавил Михаил Фрадков, вошли руководитель аппарата правительства России Сергей Нарышкин, глава Минэкономразвития России Герман Греф, министр финансов РФ Алексей Кудрин, мэр Москвы Юрий Лужков, Президент Чувашии Николай Федоров и ряд других руководителей федеральных и региональных органов исполнительной власти.

Прерогативы комиссии чрезвычайно широки: помимо общей координации работы федеральных и региональных органов она будет заниматься подготовкой проектов федеральных законов и других нормативных правовых актов, концепцией регионального развития. Комиссия также будет координировать работу по реализации федеральных целевых программ в регионах и региональных программ социально-экономического развития, международные связи и осуществлять взаимодействие по вопросам кадрового обеспечения. Согласно правительственному постановлению комиссия будет рассматривать «результаты реализации переданных полномочий федеральных органов исполнительной власти органам исполнительной власти субъектов Российской Федерации, а также отдельных государственных полномочий, переданных органам местного самоуправления».

Заседания комиссии планируется проводить не реже одного раза в месяц.